W skład Komisji Naukowej wchodzą: przewodniczący ks. dr Alojzy Ślósarczyk - wikariusz biskupi ds. metropolitalnego trybunału kościelnego we Wrocławiu, wiceprzewodniczący ks. prof. Józef Pater - rektor Papieskiego Wydziału Teologicznego we Wrocławiu, członkowie: ks. dr Marian Biskup - rektor Metropolitalnego Wyższego Seminarium Duchownego we Wrocławiu oraz ks. prof. Mieczysław Kogut z PWT i ks. prof. Wiesław Wenz - prorektor PWT.
Komisja zajmie się także materiałami dotyczącymi organizacji świeckich. Jej działalność przewiduje się na okres ok. 5 lat, a jeśli będzie tego wymagała sytuacja - nawet dłużej.
„Chodzi nam o wydobycie prawdy, a nie o sensację” - oświadczył abp Marian Gołębiewski podczas konferencji prasowej na temat nowo powołanej Komisji.
Metropolita wrocławski powiedział, że największym grzechem duchownych w tamtych latach był brak wyobraźni politycznej. Jako przykład odwrotnej postawy podał kard. Stefana Wyszyńskiego, który potrafił wyprzedzić poczynania władz i kierować Kościół przez wąskie ścieżki.
Metropolita wrocławski przypomniał również, że Kościół przeprowadził lustrację jako pierwszy. „Chodzi nam jednak o szersze spojrzenie na ten trudny, ale również bohaterski okres, było bowiem wielu wspaniałych kapłanów, którzy często przypłacali zdrowiem i życiem to, co robili” - mówił abp Gołębiewski.
O powołaniu Komisji został poinformowany prezes IPN prof. Leon Kieres. Komisja wrocławska jest trzecią tego typu po komisjach powołanych w Lublinie i Tarnowie.